Pränatale NGS-Analysen

Gen-Panel in der Pränataldiagnostik

Ein Gen-Panel ist dann sinnvoll, wenn es darum geht, eine aufgrund des fetalen Phänotyps mögliche Diagnose, die auf Veränderungen in unterschiedlichen Genen beruhen kann, gezielt nachzuweisen oder auch mit hoher Sicherheit auszuschließen.

Definierte Gen-Panel, die in der pränatalen Situation sinnvoll sein können, finden Sie auf unserem Anforderungsformular für die Pränatalmedizin:

Exom-Analysen in der Pränataldiagnostik

Wenn Karyotypisierung und Microarray unauffällig sind, bietet eine Exom Analyse abhängig von der Indikation einen durchschnittlichen diagnostischen Zugewinn von ca. 30 % . Eine Exomanalyse kann als Single-Exom oder als Trio-Exom (unter Einbeziehung elterlicher Blutproben) durchgeführt werden. 

Bedeutung der Trio-Exom Analyse:

Bei früh oder bereits pränatal manifestierenden Entwicklungsstörungen liegt mit hoher Wahrscheinlichkeit entweder eine Neumutation vor oder es handelt sich um eine rezessive Erkrankung. In beiden Fällen ist es bei der Auswertung von NGS-Analysen hilfreich zu wissen, welche Genveränderung bei den Eltern nicht vorliegt (und dann eine Neumutation beim Kind ist) bzw. vorliegt (als Anlageträgerschaft für eine rezessive Erkrankung bei beiden Elternteilen). Es ist daher sinnvoll, umfassende NGS-Analysen im Trio-Ansatz unter Einbeziehung der elterlichen Blutproben durchzuführen. Dies verringert die Anzahl unklarer Sequenzvarianten und erhöht die diagnostische Ausbeute und Sicherheit.

Bearbeitungszeit

• 7-10 Tage ab NGS-Analysestart

Kosten

• Gesetzlich Versicherte: Bei medizinischer Notwendigkeit ist die pränatale NGS-Diagnostik nach EBM Kapitel 11 abzurechnen. Für die Analyse wird ein Überweisungsschein (Muster 10, Laborüberweisungsschein) der Schwangeren benötigt.
• Privat Versicherte: Abrechnung nach GOÄ, eine Kostenaufstellung kann angefordert werden.

Benötigtes Material und Formulare

• Pränatales Untersuchungsmaterial (weiteres zu den Anforderungen siehe hier)
• Bei einer Trio-Exom Analyse wird zur analytischen Validierung der fetalen Varianten zusätzlich Untersuchungsmaterial der Eltern benötigt (jeweils 4ml EDTA-Blut). 
• Anforderungsformular mit Einwilligungserklärung für die Schwangere und ggf. den Partner: 
• Anforderungsformular - Pränatale Diagnostik

Weitere Hinweise – FAQs

• Exom-Untersuchungen erfolgen als "Klinische Exome“, in die ausschließlich Gene mit bekannter Krankheitsassoziation einbezogen werden. Die Analyse eines "Whole Exome"- ist nicht zielführend, da genetische Veränderungen in Genen, die nicht mit einer Krankheit assoziiert sind, in der pränatalen Situation keinen diagnostischen Zugewinn darstellen.

• Wie werden die NGS-Daten ausgewertet?
  Ziel der Varianteninterpretation ist es, die Ursache für den auffälligen fetalen Phänotyp zu identifizieren, um der Schwangeren eine prognostische und ggf. therapeutische Einschätzung zu geben. Dementsprechend werden nur Varianten berichtet, die zum aktuellen Zeitpunkt sicher oder mit hoher Wahrscheinlichkeit als Erklärung für den fetalen Phänotyp angesehen werden können.

• Welches fetale Material ist geeignet?
  Eine Exom-Analyse ist aus nativem Fruchtwasser, CVS-Material, Zellkulturen oder auch fetalem Nabelschnurblut möglich.

• Wie erfolgt ein Kontaminationsausschluss?
  Eine maternale Kontamination des fetalen Materials kann auch ohne Vorliegen einer Blutprobe der Schwangeren über ein bioinformatisches Analyse-Tool erkannt bzw. ausgeschlossen werden.